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肛肠的出现多数和遗传因素有关，如果家中有遗传史的话，自己患有肛肠的几率就会大大增加。除了遗传的因素，也有可能是自己的不良习惯，比如卫生情况。也有可能是青春期的身体激素分泌旺盛而导致。
.不良的习惯
个人卫生与引发肛肠有密切关系，不良的生活卫生习惯易导致体臭。人体有许多清洁时容易忽略的部位，如腹股沟、腋窝、脐部等处，并且这些部位分泌液较其他部位多。而现在的青年男女喜欢穿紧身衣、牛仔裤等， 皮肤与衣服紧贴，不利于分泌液的挥发，使得这些部位温度高、湿度大，从而有利于细菌的滋生、分解，产生具有特殊肛肠的臭味的短链脂肪酸和氨。
.遗传因素
在肛肠患者中有相当一部分人是因为遗传，临床去肛肠上所见病例几乎都有家族史，患者的父母中有一方一定有这样的病史。手术虽然能解决患者肛肠问题，但并未改变患者的遗传性，因此仍有可能遗传给下一代。
.年龄因素
进入青春期后，体内顶泌汗腺开始有了分泌功能，随着人体内的内分泌以及激素分泌旺盛，顶泌汗腺也逐渐分泌旺盛，并且由于一些部位清洗时容易被忽略，给细菌的产生创造了温床，从而使肛肠的病因逐渐加重。肛肠一般在人体岁以后，随着人体内汗腺逐渐萎缩，功能逐渐退化，肛肠也会逐渐减弱消失。这也是老年人很少患有肛肠的原因。
.环境因素
同样属于肛肠的原因，当肛肠患者所处环境温度一高，或心情较紧张，腋下就会不正常的过度出汗，并且发出令人不悦的味道。并且过多的流汗和肛肠，会把衣服染黄，留下的味道也不容易清洗。肛肠的症状青春期最为明显，夏季天热则容易加重。
.顶泌汗液的作用
这是女性朋友患上肛肠的常见原因。顶泌汗腺只存在于腋窝、乳晕、脐窝、肛门、外阴和外耳道等部位，除腋窝外，该腺体在其他部位的功能极弱所以产生的汗液极少。顶泌汗腺分泌的汗液初始是无菌的，但是在微生物的作用下，就会分解汗液中的有机物，形成具有特殊肛肠的臭味的短链脂肪酸和氨。
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